Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Trappc6bQ9D289 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Trappc6bQ9D289 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Trappc6bQ9D289 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Trappc6bQ9D289 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Trappc6bQ9D289 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Trappc6bQ9D289 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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