Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Necap2Q9D1J1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Necap2Q9D1J1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms