Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms