Protein–RNA interactions for Protein: Q9D110

Mthfs, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfsQ9D110 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MthfsQ9D110 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MthfsQ9D110 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms