Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ccdc47Q9D024 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ccdc47Q9D024 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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