Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp2Q9CYZ8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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