Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Wdr55Q9CX97 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms