Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Utp23Q9CX11 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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