Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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