Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PompQ9CQT5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PompQ9CQT5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms