Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trappc5Q9CQA1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trappc5Q9CQA1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trappc5Q9CQA1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trappc5Q9CQA1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc5Q9CQA1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms