Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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