Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ms4a6cQ99N08 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ms4a6cQ99N08 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ms4a6cQ99N08 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ms4a6cQ99N08 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ms4a6cQ99N08 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ms4a6cQ99N08 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ms4a6cQ99N08 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ms4a6cQ99N08 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Ms4a6cQ99N08 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ms4a6cQ99N08 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Ms4a6cQ99N08 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ms4a6cQ99N08 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6cQ99N08 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ms4a6cQ99N08 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6cQ99N08 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6cQ99N08 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ms4a6cQ99N08 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ms4a6cQ99N08 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6cQ99N08 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6cQ99N08 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6cQ99N08 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6cQ99N08 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ms4a6cQ99N08 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6cQ99N08 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6cQ99N08 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ms4a6cQ99N08 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ms4a6cQ99N08 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ms4a6cQ99N08 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ms4a6cQ99N08 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms