Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms