Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q99KU6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q99KU6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q99KU6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q99KU6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q99KU6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q99KU6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q99KU6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q99KU6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q99KU6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q99KU6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q99KU6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q99KU6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q99KU6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q99KU6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q99KU6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q99KU6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q99KU6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q99KU6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q99KU6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q99KU6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q99KU6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q99KU6 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms