Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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