Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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