Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rpap2Q8VC34 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpap2Q8VC34 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpap2Q8VC34 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpap2Q8VC34 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpap2Q8VC34 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpap2Q8VC34 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rpap2Q8VC34 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpap2Q8VC34 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpap2Q8VC34 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rpap2Q8VC34 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rpap2Q8VC34 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rpap2Q8VC34 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rpap2Q8VC34 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpap2Q8VC34 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rpap2Q8VC34 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rpap2Q8VC34 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rpap2Q8VC34 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpap2Q8VC34 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpap2Q8VC34 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpap2Q8VC34 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpap2Q8VC34 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpap2Q8VC34 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpap2Q8VC34 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpap2Q8VC34 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpap2Q8VC34 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpap2Q8VC34 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpap2Q8VC34 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpap2Q8VC34 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpap2Q8VC34 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpap2Q8VC34 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpap2Q8VC34 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpap2Q8VC34 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpap2Q8VC34 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpap2Q8VC34 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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