Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Top1mtQ8R4U6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Top1mtQ8R4U6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Top1mtQ8R4U6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Top1mtQ8R4U6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Top1mtQ8R4U6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Top1mtQ8R4U6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Top1mtQ8R4U6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Top1mtQ8R4U6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Top1mtQ8R4U6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Top1mtQ8R4U6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1mtQ8R4U6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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