Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmpQ8R373 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ClmpQ8R373 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms