Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms