Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Depp1Q8K2F3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms