Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Abcf3Q8K268 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Abcf3Q8K268 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Abcf3Q8K268 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Abcf3Q8K268 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Abcf3Q8K268 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Abcf3Q8K268 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Abcf3Q8K268 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Abcf3Q8K268 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Abcf3Q8K268 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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