Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms