Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI19

Pdgfc, Platelet-derived growth factor C, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfcQ8CI19 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PdgfcQ8CI19 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PdgfcQ8CI19 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PdgfcQ8CI19 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PdgfcQ8CI19 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PdgfcQ8CI19 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PdgfcQ8CI19 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PdgfcQ8CI19 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PdgfcQ8CI19 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PdgfcQ8CI19 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PdgfcQ8CI19 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PdgfcQ8CI19 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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