Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rdh13Q8CEE7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rdh13Q8CEE7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rdh13Q8CEE7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rdh13Q8CEE7 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rdh13Q8CEE7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh13Q8CEE7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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