Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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