Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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FarsaQ8C0C7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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FarsaQ8C0C7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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FarsaQ8C0C7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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FarsaQ8C0C7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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FarsaQ8C0C7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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FarsaQ8C0C7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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FarsaQ8C0C7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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FarsaQ8C0C7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FarsaQ8C0C7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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