Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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Zfp398Q8BV16 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Zfp398Q8BV16 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Zfp398Q8BV16 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Zfp398Q8BV16 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Zfp398Q8BV16 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Zfp398Q8BV16 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Zfp398Q8BV16 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Zfp398Q8BV16 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Zfp398Q8BV16 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zfp398Q8BV16 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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