Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
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