Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc28Q80XJ3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ttc28Q80XJ3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ttc28Q80XJ3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ttc28Q80XJ3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ttc28Q80XJ3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ttc28Q80XJ3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ttc28Q80XJ3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ttc28Q80XJ3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ttc28Q80XJ3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ttc28Q80XJ3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ttc28Q80XJ3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ttc28Q80XJ3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ttc28Q80XJ3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Ttc28Q80XJ3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Ttc28Q80XJ3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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