Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms