Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
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Npm2Q80W85 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms