Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms