Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtminQ6P9S1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AtminQ6P9S1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms