Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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NipblQ6KCD5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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NipblQ6KCD5 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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NipblQ6KCD5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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NipblQ6KCD5 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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