Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sohlh1Q6IUP1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms