Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt39Q6IFX4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt39Q6IFX4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt39Q6IFX4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt39Q6IFX4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt39Q6IFX4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt39Q6IFX4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt39Q6IFX4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt39Q6IFX4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt39Q6IFX4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt39Q6IFX4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt39Q6IFX4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt39Q6IFX4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt39Q6IFX4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt39Q6IFX4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt39Q6IFX4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt39Q6IFX4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt39Q6IFX4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt39Q6IFX4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt39Q6IFX4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Krt39Q6IFX4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Krt39Q6IFX4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Krt39Q6IFX4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Krt39Q6IFX4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Krt39Q6IFX4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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