Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms