Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.1 ms