Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms