Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atp13a3Q5XF89 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms