Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim41Q5NCC3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim41Q5NCC3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms