Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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