Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms