Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Arfgef3Q3UGY8 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Arfgef3Q3UGY8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Arfgef3Q3UGY8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Arfgef3Q3UGY8 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Arfgef3Q3UGY8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Arfgef3Q3UGY8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Arfgef3Q3UGY8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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Arfgef3Q3UGY8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Arfgef3Q3UGY8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Arfgef3Q3UGY8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms