Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

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Length 525 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbp8Q2V6D6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms