Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms