Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms