Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spata18Q0P557 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms